Na madrugada deste domingo, cerca de 200 soldados invadiram o palácio presidencial e renderam a segurança. Aproximadamente 20 minutos depois, o presidente Manuel Zelaya foi preso e levado para base da Força Aérea, de onde foi transferido para a Costa Rica.
Horas depois, a Corte Suprema anunciou a renúncia do presidente Zelaya e a validação do golpe militar. De acordo com ordem judicial, a eleição presidencial deve ser marcada para o dia 29 de novembro de 2009.
O Congresso de Honduras aprovou neste domingo, a nomeação do presidente parlamentar, Roberto Micheletti, como o novo presidente do país. O novo Ministro das Relações Exteriores, Enrique Colindres, foi imediatamente nomeado para substituir sua antecessora, Patrícia Rodas.
Milhares de pessoas saíram às ruas da capital, Tegucigalpa, a fim de protestar contra a prisão e o exílio de Zelaya.